Dans ce tutoriel, je vais expliquer comment transformer vos données DICOM extraites de votre scanner en un fichier imprimable en 3D.

Rendez-vous sur https://www.slicer.org/ , téléchargez le logiciel et installez-le.
Ouvrez-le et cliquez sur import DICOM files, recherchez le dossier contenant vos fichiers DICOM et cliquez sur import.

Cliquez sur show DICOM database, cliquez sur votre nom, puis double-cliquez sur les coupes qui vous intéressent, ici sinus. Les coupes vont se charger.

Cliquez maintenant sur le menu déroulant et choisissez volume rendering.

Cliquez sur display ROI ; des lignes blanches apparaîtront.
Vous pouvez cliquer sur le point blanc à côté de Volume ; votre tête apparaîtra en 3D. Mais cela est facultatif.

Vous pouvez également sélectionner un préréglage ; ici, je choisis lung, ce qui permet de voir l’intérieur de la cavité nasale.
Recadrez maintenant la zone souhaitée à l’aide du point coloré.

Lorsque la zone recadrée vous convient, cliquez sur la petite loupe, saisissez crop, cliquez sur crop volume, puis sur switch to module. Cliquez ensuite sur le bouton apply. Patientez un instant, cela peut prendre un certain temps.

Retournez maintenant à l’ Volume rendering et cliquez sur display ROI afin de masquer les lignes blanches
Une fois cela fait, cliquez à nouveau sur la petite loupe et saisissez editor, puis cliquez sur switch to module.
Une petite fenêtre apparaîtra ; cliquez sur OK.

Cliquez sur le bouton de l’effet de seuillage.

Les coupes vont devenir vertes ; vous devez maintenant ajuster le curseur de gauche afin de colorer en vert tous vos tissus mous.
J’ai constaté que les bonnes valeurs se situent généralement entre -200 et -400, mais cela peut dépendre du scanner.
Enfin, cliquez sur le bouton apply.
C’est presque terminé, nous avons effectué la plus grande partie du travail.

Cliquez maintenant sur data dans le menu.

Faites un clic droit sur votre « name files » cropped-label, puis cliquez sur Convert labelmap to segmentation mode.

Une ligne tissue apparaîtra ; faites à nouveau un clic droit dessus, puis cliquez sur Export visible segment to models.
Patientez un instant, cela peut prendre un certain temps : une ligne cropped-label-segmentation-models apparaîtra, ainsi que votre modèle 3D dans la fenêtre de droite.

Cliquez sur file, puis sur save ou appuyez sur Ctrl + S.
Dans la fenêtre, décochez toutes les cases sauf tissue.
Cliquez sur Poly data (.vtk) et choisissez .STL.
Cliquez sur change directory for selected files et choisissez le dossier dans lequel vous souhaitez enregistrer le fichier du modèle 3D.
Enfin, cliquez sur save et voilà, c’est terminé !

Ce fichier .STL est un fichier 3D qui peut être utilisé directement pour imprimer le modèle en 3D, mais comme vous pouvez l’imaginer, il n’est pas utile d’imprimer le modèle dans cet état : nous ne verrions rien. Nous devons voir l’intérieur de la cavité nasale.
C’est pourquoi, dans le prochain tutoriel, j’expliquerai comment découper le modèle en tranches afin d’en voir l’intérieur. Les tranches pourront être empilées.