このチュートリアルでは、CTスキャンから取得したDICOMデータを、3Dプリント可能なファイルに変換する方法を説明します。
https://www.slicer.org/ にアクセスし、ソフトウェアをダウンロードしてインストールします。
ソフトウェアを開き、import DICOM filesをクリックします。DICOMファイルのディレクトリを探し、importをクリックします。
show DICOM databaseをクリックし、自分の名前をクリックします。最後に、関心のあるスライス（ここでは副鼻腔）をダブルクリックします。スライスが読み込まれます。
次にスクロールメニューをクリックし、volume renderingを選択します。
display ROIをクリックすると、白い線が表示されます。
Volumeの横にある白い点をクリックすると、頭部が3Dで表示されます。ただし、これは任意です。
プリセットも選択できます。ここでは肺を選ぶと、鼻腔の内部を見ることができます。
次に、カラードットを使って目的の範囲を切り取ります。
切り取る範囲が決まったら、小さな虫眼鏡をクリックし、「crop」と入力して、crop volumeをクリックし、最後にswitch to moduleをクリックします。その後、適用ボタンをクリックします。少し時間がかかる場合があります。
Now return to the Volume rendering worshop and click on display ROI in order to hide white lines
Once it's done, click again on the little magnifying glass and write editor, then click on switch to module.
A little window will appear, click OK.
threshold effectボタンをクリックします。
スライスが緑色になります。次に、左側のカーソルを調整して、すべての軟部組織を緑色に塗ります。
一般的に適切な数値は-200から-400の間だと思いますが、CTスキャンによって異なる場合があります。
最後に、applyボタンをクリックします。
ほぼ完了です。大部分の作業は終わりました。
メニューのdataをクリックします。
「name files」のcropped-labelを右クリックし、「Convert labelmap to segmentation mode」をクリックします。
tissueという行が表示されます。もう一度それを右クリックし、Export visible segment to modelsをクリックします。
少し待ちます。時間がかかる場合があります。cropped-label-segmentation-modelsという行が表示され、右側のウィンドウには3Dモデルも表示されます。
「file」をクリックし、「save」またはCtrl + Sを押します。
ウィンドウで、tissue以外のすべてのボックスのチェックを外します。
「Poly data (.vtk)」をクリックし、「.STL」を選択します。
change directory for selected filesをクリックし、3Dモデルファイルを保存したいディレクトリを選択します。
最後に「save」をクリックすれば完了です。よくできました！
この.STLファイルは、モデルをそのまま3Dプリントするために使用できる3Dファイルです。しかし、想像できるように、この状態でモデルを3Dプリントしても役に立ちません。何も見えないからです。鼻腔の内部を見る必要があります。
そこで次回のチュートリアルでは、内部が見えるようにモデルをスライスに分割する方法を説明します。スライスは積み重ねることができます。