In deze tutorial leg ik uit hoe je de DICOM-gegevens uit je CT-scan omzet in een bestand dat klaar is om 3D te worden geprint.
Ga naar https://www.slicer.org/ , download de software en installeer deze.
Open het programma en klik op import DICOM files. Zoek de map met je DICOM-bestanden en klik op import.
Klik op show DICOM database, klik op je naam en dubbelklik ten slotte op de doorsneden waarin je geïnteresseerd bent, in dit geval sinus. De doorsneden worden geladen.
Klik nu op het vervolgkeuzemenu en kies volume rendering.

Klik op display ROI; er verschijnen witte lijnen.
Je kunt op de witte stip naast Volume klikken; je hoofd verschijnt dan in 3D. Maar dit is optioneel.
Je kunt ook een voorinstelling selecteren; hier kies ik voor longen, zodat je in de neusholte kunt kijken.
Snijd nu de gewenste zone bij met behulp van de gekleurde stip.
Als je tevreden bent met het bijgesneden gebied, klik je op het kleine vergrootglas, typ je crop, klik je op crop volume en ten slotte op switch to module. Klik daarna op de knop Apply. Wacht even, dit kan enige tijd duren.
Ga nu terug naar de Volume rendering-werkruimte en klik op display ROI om de witte lijnen te verbergen
Klik daarna opnieuw op het kleine vergrootglas en typ editor; klik vervolgens op switch to module.
Er verschijnt een klein venster; klik op OK.

Klik op de knop Threshold effect.
De coupes worden groen. Je moet nu de linker cursor aanpassen zodat al je zachte weefsels groen worden.
Ik heb gemerkt dat de juiste waarden meestal tussen -200 en -400 liggen, maar dit kan afhangen van de CT-scan.
Klik ten slotte op de knop apply.
We zijn bijna klaar; het grootste deel is gedaan.
Klik nu op data in het menu.

Klik met de rechtermuisknop op je bijgesneden label "name files" en klik op Convert labelmap to segmentation mode.

Er verschijnt een regel tissue. Klik er opnieuw met de rechtermuisknop op en selecteer Export visible segment to models.
Wacht even, dit kan enige tijd duren. Er verschijnt een regel cropped-label-segmentation-models en ook je 3D-model in het rechtervenster.

Klik op File en vervolgens op Save, of druk op Ctrl + S.
Schakel in het venster alle vakjes uit, behalve tissue.
Klik op Poly data (.vtk) en kies .STL.
Klik op change directory for selected files en kies de map waarin je het 3D-modelbestand wilt opslaan.
Klik ten slotte op Save en voilà, goed gedaan!

Dit .STL-bestand is een 3D-bestand dat je kunt gebruiken om het model rechtstreeks 3D te printen, maar zoals je je kunt voorstellen heeft het in deze staat geen zin om het model 3D te printen: we zullen niets zien. We moeten de binnenkant van de neusholte kunnen zien.
Daarom leg ik in de volgende tutorial uit hoe je het model in coupes kunt snijden om de binnenkant te bekijken. De coupes kunnen op elkaar worden gestapeld.
